东海原甲藻的分子鉴定
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篇1：东海原甲藻的分子鉴定
东海原甲藻的分子鉴定
采用nrDNA ITS序列及18S序列两种分子标记,对东海原甲藻和美国国家海洋藻种保藏中心(CCMP)的具齿原甲藻进行分子鉴定,结果表明,两者之间序列非常相似,两者的nrDNA ITS序列碱基差异值仅为0.002,nrDNA 18S序列的碱基差异值为O.000,根据分子数据,东海原甲藻和美国国家海洋藻种保藏中心的具齿原甲藻应为同一个种.从基因库获取原甲藻的另外3个种nrD-NA ITS序列和8个种的18S序列,用计算机软件进行分析和构建分子系统树,结果显示18S序列用于原甲藻的'分子鉴定过于保守,而nrDNA ITS更适合于该种属界定的分子标准.
作 者：罗立明 胡鸿钧 李夜光 齐雨藻 吕颂辉 耿亚红 邓光 LUO Li-ming HU Hong-jun LI Ye-guang QI Yu-zao L(U) Song-hui GENG Ya-hong DENG Guang 作者单位：罗立明,胡鸿钧,李夜光,耿亚红,邓光,LUO Li-ming,HU Hong-jun,LI Ye-guang,GENG Ya-hong,DENG Guang(中国科学院,武汉植物园/武汉植物研究所,湖北,武汉,430074)齐雨藻,吕颂辉,QI Yu-zao,L(U) Song-hui(暨南大学,水生生物研究所,广东,广州,520632)
刊 名：海洋学报（中文版） ISTIC PKU英文刊名：ACTA OCEANOLOGICA SINICA 年，卷(期)： 28(1) 分类号：Q948.885.3 关键词：东海原甲藻 具齿原甲藻 nrDNA ITS nrDNA 18S 分子鉴定篇2：东海原甲藻的光周期效应研究
东海原甲藻的光周期效应研究
以东海原甲藻Prorocentrum donghaiense Lu为试验材料,设置了短光周期(A)和长光周期(B)两组试验:A组分光周期1、2、4、6、8、10和12 h 7个处理,B组分光周期12、14、16、18、20、22和23 h 7个处理,测定了东海原甲藻的细胞密度、叶绿素a含量、蛋白质含量、生物量和可溶性糖等指标.结果表明,在13个不同的'光周期处理中,随着光周期的不断延长,东海原甲藻的细胞密度等一系列指标值均不断上升,各指标和光周期的长度呈现正相关的关系.结果表明东海原甲藻是一种喜长光照的赤潮藻类.
作 者：孙岁寒 段舜山 SUN Suihan DUAN Shunshan 作者单位：暨南大学水生生物研究所,广东,广州,510632 刊 名：生态环境 ISTIC PKU英文刊名：ECOLOGY AND ENVIRONMENT 年，卷(期)：2006 15(3) 分类号：Q949.210 关键词：东海原甲藻 光周期 叶绿素-a 蛋白质 生物量 可溶性糖篇3：东海原甲藻cDNA文库构建及尝试性EST分析
东海原甲藻cDNA文库构建及尝试性EST分析
东海原甲藻(Prorocentrum donghaiense)是中国沿海频繁发生的大规模赤潮的原因种之一,大规模分离鉴定东海原甲藻功能基因是理解东海原甲藻赤潮形成过程和机理的重要基础.取对数生长期藻体,经微量总RNA抽提、cDNA合成、cDNA扩增和克隆等步骤,构建了东海原甲藻cDNA文库并进行了尝试性表达序列标签分析.从含有约5000个转化子的.文库中随机取150个测序,获得126条EST序列.经网上BlastN及BlastX分析,共发现11个是已知功能的基因的标签.这些基因与东海原甲藻生长发育、物质转换和能量代谢相关.
作 者：张秀芳 杨官品 刘永建 李瑞香 朱明远 ZHANG Xiu-Fang YANG Guan-Pin LIU Yong-Jian LI Rui-Xiang ZHU Ming-Yuan 作者单位：张秀芳,杨官品,刘永建,ZHANG Xiu-Fang,YANG Guan-Pin,LIU Yong-Jian(中国海洋大学生命科学与技术学部,山东,青岛,266003)李瑞香,朱明远,LI Rui-Xiang,ZHU Ming-Yuan(国家海洋局第一海洋研究所,山东,青岛,266061)
刊 名：中国海洋大学学报（自然科学版） ISTIC PKU英文刊名：PERIODICAL OF OCEAN UNIVERSITY OF CHINA 年，卷(期)： 36(3) 分类号：Q786 Q948.116 关键词：东海原甲藻 cDNA PCR文库 表达序列标签篇4：细菌产绿脓菌素对东海原甲藻生长的影响
细菌产绿脓菌素对东海原甲藻生长的影响
以东海原甲藻(Prorocentrum donghaiense)为实验材料,研究了铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)产绿脓菌素对藻细胞生长的影响.结果表明,当其浓度达到5.0 mg・L-1时,对东海原甲藻的生长表现出明显的抑制效果,并且抑制效果随浓度的增加而增强.对裸甲藻而言,当其浓度增加至15.0 mg・L-1时,裸甲藻的生长才开始受到较明显的抑制.8.0和15.0 mg・L-1的绿脓菌素在实验初期对湛江叉鞭金藻的生长表现出了一定的.抑制作用,但这种抑制作用不能持久. 对绿藻而言,即使浓度增加至 15.0 mg・L-1,绿藻的生长受其影响也很弱.本文首次探讨了细菌产绿脓菌素对东海原甲藻的抑制作用,结果表明该类物质可以选择性的抑制东海原甲藻的生长.
作 者：李雁宾 龚良玉 王修林 粱生康 韩秀荣 祝陈坚 LI Yan-bin GONG Liang-yu WANG Xiu-lin LIANG Sheng-kang HAN Xiu-rong ZHU Chen-jian 作者单位：李雁宾,LI Yan-bin(中国海洋大学,化学化工学院,山东,青岛,266003;中国海洋大学,生命科学学院,山东,青岛,266003)龚良玉,王修林,粱生康,韩秀荣,祝陈坚,GONG Liang-yu,WANG Xiu-lin,LIANG Sheng-kang,HAN Xiu-rong,ZHU Chen-jian(中国海洋大学,化学化工学院,山东,青岛,266003)
刊 名：海洋环境科学 ISTIC PKU英文刊名：MARINE ENVIRONMENTAL SCIENCE 年，卷(期)： 24(3) 分类号：X55 R378.99+1 X503.23 关键词：东海原甲藻 铜绿假单胞菌 绿脓菌素 选择性抑制篇5：舟山海域春季浮游植物生物量及东海原甲藻赤潮频发机制初探
舟山海域春季浮游植物生物量及东海原甲藻赤潮频发机制初探
通过和春季2个航次对东海舟山群岛及其邻域大面站的浮游植物及期间爆发的大规模东海原甲藻(Prorocentrum donghaiense)赤潮的综合调查,研究了调查海区浮游植物叶绿素a和营养盐的分布特性,分析了赤潮高发区域的.生态环境特征,探讨了诱发和控制海域赤潮发生的环境因子.结果表明,2002和20春季大面站表层平均叶绿素a浓度分别为1.09±1.63和4.21±5.33 mg・m-3,调查海区平均为0.70±0.48和2.60±2.99 mg・m-3,叶绿素a浓度的高值区基本上位于122.5°～123°E间冲淡水形成的锋面区域,此区域营养盐可以得到充分补充,光照条件适宜,也是浮游植物生产力的高值带.2002和年东海原甲藻赤潮跟踪期间,表层平均叶绿素a浓度分别高达18.45±11.04和12.47±8.15 mg・m-3.赤潮发生海域盐度在26～30,赤潮藻生长易受磷的限制.光照条件适宜、营养盐(特别是磷酸盐)能得到较快的补充及锋面辐聚带的形成是赤潮形成的重要条件.
作 者：周伟华 殷克东 朱德第 ZHOU Weihua YIN Kedong ZHU Dedi 作者单位：周伟华,ZHOU Weihua(中国科学院南海海洋研究所,广州,510301;中国科学院海南热带海洋生物实验站,三亚,57)殷克东,YIN Kedong(中国科学院南海海洋研究所,广州,510301;中国科学院热带海洋环境动力学重点实验室,广州,510301)
朱德第,ZHU Dedi(国家海洋局第二海洋研究所,杭州,310012)
刊 名：应用生态学报 ISTIC PKU英文刊名：CHINESE JOURNAL OF APPLIED ECOLOGY 年，卷(期)： 17(5) 分类号：Q178.53 关键词：舟山海域 浮游植物生物量 东海原甲藻 赤潮篇6：春初浙江近海的低温特征及其对大规模东海原甲藻赤潮发生的影响
春初浙江近海的低温特征及其对大规模东海原甲藻赤潮发生的影响
在长江口附近和浙江近海海域,近些年来每年春季几乎都发生大规模的东海原甲藻(Prorocentrum donghaiense)赤潮,时间通常是在4月底或5月初,但20却一直到5月底才发生.本文根据近几年在浙江近海进行的多个春季航次的调查资料和有关站位的气象资料,分析了该海区年春初的温度特征及其对大规模东海原甲藻赤潮发生的影响,阐明了2005年春季大规模东海原甲藻赤潮迟发的主要物理环境原因.结果表明,2005年3月浙江近海水温比多年同期平均值偏低,且这种情况在近岸区更为明显;与同期相比,2005年春初(4月初)浙江近海水温偏低,2005年和20的这种水温差异在近岸和中上层的低盐水里最为明显,而在远岸和下层的高盐水水温差异则相对要小;近岸低盐水最低温度2005年比年低约2.6℃;2005年1-3月浙江近海特殊的气象条件(10 a中最低的气温和强劲的`偏北大风)和2004/2005年冬季较弱的台湾暖流是形成4月初浙江近海低温特征的主要原因;2004年冬季和2005年春初浙江近水温偏低很可能是2005年春季东海大规模原甲藻赤潮迟发的主要原因.
作 者：朱德弟 陆斗定 王云峰 苏纪兰 ZHU De-di LU Dou-ding WANG Yun-feng SU Ji-lan 作者单位：朱德弟,苏纪兰,ZHU De-di,SU Ji-lan(国家海洋局,第二海洋研究所,卫星海洋环境动力学国家重点实验室,浙江,杭州,310012;国家海洋局,第二海洋研究所,浙江,杭州,310012)陆斗定,LU Dou-ding(国家海洋局,第二海洋研究所,浙江,杭州,310012)
王云峰,WANG Yun-feng(中国科学院海洋研究所,山东,青岛,266071)
刊 名：海洋学报（中文版） ISTIC PKU英文刊名：ACTA OCEANOLOGICA SINICA 年，卷(期)： 31(6) 分类号：P731.11 Q142 关键词：浙江近海 大规模东海原甲藻赤潮 低温特征 Zhejiang coastal region (large scale HAB of Prorocentrum donghaiense low temperature characteristic篇7：真菌的分子鉴定
真菌的分子鉴定
真菌的分子鉴定内生真菌(Endophyticfungi)是指那些在其生活史中的某一段时期生活在植物组织内，对植物组织没有引起明显病害症状的真菌。近年来的研究表明，内生真菌可以产生与宿主相同或相似的代谢产物，对相应的内生真菌及其代谢产物的研究已经成为寻找药物来源的一种新途经。 本文以我国特有药用植物――喜树(CamptothecaacuminataDecne.)为实验材料，对喜树内生真菌的组织分布及分离方法进行初步研究。实验结果表明，内生真菌分离的表面消毒以75%酒精和0.1%升汞结合的方法较好。对喜树的根部和茎部的升汞消毒时间以4～5min为宜，喜树叶子的升汞消毒时间应控制在2min左右。在所试条件下共计分离得到70株内生真菌，主要分布在树叶(42.9%)和皮部(35.7%)，根部(14.3%)和种子(7.1%)中的内生真菌数目较少，在木质部未分离到内生真菌。 采用形态学和分子生物学结合的方法对所得菌株进行鉴定。应用形态学方法共鉴定出6株内生真菌，分布于6属。按照培养特征，把所得内生真菌归为27个形态类群。选取不同形态类群中的`代表菌株，扩增并测定其rDNAITS区段的DNA序列，结合内生真菌与GenBank中参考菌株碱基序列相似性和系统发育关系分析，确定其分类地位。共获得18株内生真菌的ITS序列，分析结果表明，这18株内生真菌分属于2个亚门，4纲，8目，8科，14属;形态学鉴定与分子生物学鉴定结果一致。鉴定结果在一定程度上反应了喜树生态系内生真菌的生物多样性。在本研究中，共分离得到18株拟茎点霉属(Phomopsis)菌株，占25.7%，为优势菌群，对其进行了基于ITS区段的系统发育分析。 本文采用薄层层析TLC方法与高效液相色谱HPLC法，从3株内生真菌CZ-14、CZ-17、CZ-18的发酵产物中检出喜树碱，含量为0.03-0.04mg/g。发酵产物是以喜树种子煎汁液体培养基培养。
内生真菌(Endophyticfungi)是指那些在其生活史中的某一段时期生活在植物组织内，对植物组织没有引起明显病害症状的真菌。近年来的研究表明，内生真菌可以产生与宿主相同或相似的代谢产物，对相应的内生真菌及其代谢产物的研究已经成为寻找药物来源的一种新途经。 本文以我国特有药用植物――喜树(CamptothecaacuminataDecne.)为实验材料，对喜树内生真菌的组织分布及分离方法进行初步研究。实验结果表明，内生真菌分离的表面消毒以75%酒精和0.1%升汞结合的方法较好。对喜树的根部和茎部的升汞消毒时间以4～5min为宜，喜树叶子的升汞消毒时间应控制在2min左右。在所试条件下共计分离得到70株内生真菌，主要分布在树叶(42.9%)和皮部(35.7%)，根部(14.3%)和种子(7.1%)中的内生真菌数目较少，在木质部未分离到内生真菌。 采用形态学和分子生物学结合的方法对所得菌株进行鉴定。应用形态学方法共鉴定出6株内生真菌，分布于6属。按照培养特征，把所得内生真菌归为27个形态类群。选取不同形态类群中的代表菌株，扩增并测定其rDNAITS区段的DNA序列，结合内生真菌与GenBank中参考菌株碱基序列相似性和系统发育关系分析，确定其分类地位。共获得18株内生真菌的ITS序列，分析结果表明，这18株内生真菌分属于2个亚门，4纲，8目，8科，14属;形态学鉴定与分子生物学鉴定结果一致。鉴定结果在一定程度上反应了喜树生态系内生真菌的生物多样性。在本研究中，共分离得到18株拟茎点霉属(Phomopsis)菌株，占25.7%，为优势菌群，对其进行了基于ITS区段的系统发育分析。 本文采用薄层层析TLC方法与高效液相色谱HPLC法，从3株内生真菌CZ-14、CZ-17、CZ-18的发酵产物中检出喜树碱，含量为0.03-0.04mg/g。发酵产物是以喜树种子煎汁液体培养基培养。
篇8：海产品中霍乱弧菌的分离及分子鉴定
海产品中霍乱弧菌的分离及分子鉴定
从西宁的两个海产品销售点采集海产品共60份,按常规的.处理方法和生化鉴定得到5株霍乱弧菌;根据已发表霍乱弧菌的外膜蛋白(omp)基因序列,设计合成了一对引物,用分离所得霍乱弧菌建立PCR检测方法.经试验验证建立的PCR检测体系特异性及敏感性均较好,最低检测下限可达2.4×102cfu/mL.
作 者：贺晓龙 HE Xiao-long 作者单位：青海大学农牧学院,青海,西宁,810003 刊 名：青海大学学报（自然科学版） 英文刊名：JOURNAL OF QINGHAI UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE) 年，卷(期)： 27(3) 分类号：Q93-331 关键词：霍乱弧菌 海产品 外膜蛋白篇9：药用植物紫花地丁的分子鉴定及其亲缘关系研究
药用植物紫花地丁的分子鉴定及其亲缘关系研究
运用RAPD技术对传统药用植物紫花地丁(Viola yedoensis)及其7个近缘种进行了分析,筛选出的6个随机引物在8个种39份材料中共扩增出163个位点,其中161个位点具有多态性,占98.7%;在扩增产物中有7条特异性扩增条带可用于紫花地丁的鉴定.根据RAPD结果计算的各种间遗传距离的范围为0.022 7-0.424 4,斑叶堇菜与细距堇菜的亲缘关系最近,它们间的遗传距离最小(0.022 7), 而与紫花地丁遗传距离最近的是早开堇菜,为0.147 1.在所研究的类群中,维西堇菜与裂叶堇菜的.遗传距离最大(0.424 4).根据遗传距离所作的聚类分析结果与紫花地丁等8种植物的形态分化相一致,此外,同一种的不同个体总是先聚在一起,反映了种内不同个体在遗传组成上相对一致性.研究结果表明,RAPD在种内是相对稳定的,能快速、准确地应用于紫花地丁的分子鉴定及其与近缘类群关系的研究.
作 者：苏雪 孙坤 陈纹 张辉 马瑞君 SU Xue SUN Kun CHEN Wen ZHANG Hui MA Rui-jun 作者单位：西北师范大学生命科学学院,甘肃兰州,730070 刊 名：中兽医医药杂志 英文刊名：JOURNAL OF TRADITIONAL CHINESE VETERINARY MEDICINE 年，卷(期)：2009 28(2) 分类号：S853.7 关键词：紫花地丁 RAPD 鉴定 近缘种【东海原甲藻的分子鉴定】相关文章：
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