乌骨鸡蛋用系群体遗传结构的微卫星标记分析
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篇1:乌骨鸡蛋用系群体遗传结构的微卫星标记分析
乌骨鸡蛋用系群体遗传结构的微卫星标记分析
用20对微卫星引物对丝羽乌骨鸡BM、BF两个蛋用新品系的`基因组DNA进行扩增,应用多重PCR结合全自动电泳技术分析群体遗传结构.试验结果表明:18个微卫星标记表现出丰富的多态性,每个标记平均检测到7.444个等位基因(3~15个),平均观测杂合度为0.3962,平均预期杂合度为0.7301,平均多态信息含量为0.669.本研究的标记检测结果比以前的研究报道值要高,说明全自动电泳分析技术比聚丙烯酰胺凝胶电泳结合银染法检测电泳结果的传统方法要精确,能更好地用于群体遗传结构的分析.
作 者:朱庆 张义正 孟祥军 刘益平ZHU Qing ZHANG Yi-Zheng MENG Xiang-Jun LIU Yi-Ping 作者单位:朱庆,ZHU Qing(四川大学生命科学学院,成都,610064;四川农业大学动物科技学院,雅安,625014)张义正,ZHANG Yi-Zheng(四川大学生命科学学院,成都,610064)
孟祥军,刘益平,MENG Xiang-Jun,LIU Yi-Ping(四川农业大学动物科技学院,雅安,625014)
刊 名:遗传 ISTIC PKU英文刊名:HEREDITAS(BEIJING) 年,卷(期): 28(2) 分类号:Q953 关键词:乌骨鸡 微卫星标记 群体遗传结构篇2:五个山羊群体微卫星标记的遗传多样性分析
五个山羊群体微卫星标记的遗传多样性分析
利用微卫星标记技术,分析了山西黎城大青羊、吕粱黑山羊、波尔山羊、南江黄羊(黑)、南江黄羊(黄)五个山羊群体的分子水平上的.遗传多样性,结果表明:7个微卫星住点均为高度多态位点,可以用于山羊群体遗传多样性的评估;平均多态信息含量(PIC)达0.8341~0.9026;5个山羊群体平均观察杂合度(0.6258~0.8629)均低于平均期望杂合度(0.8594~0.9115),证明5个山羊种群具有丰富的遗传多样性和广泛的遗传基础,但品种内存在着一定程度的近交,尤其波尔山羊近交较严重.以Nei氏标准遗传距离为基础的UPGMA和N-J聚类结果表明:吕粱黑山羊与南江黄羊(黑)首先聚为一类,而没和黎城大青羊先聚;国内四个山羊群体与国外品种波尔山羊亲缘关系较远.
作 者:常新建 任有蛇 岳文斌 姚继广 杨子森 王慧生 赵兴财 白海全 CHANG Xin-jian REN You-she YUE Wen-bin YAO Ji-guang YANG Zi-sen WANG Hui-sheng ZHAO Xi-cai BAI Hai-quan 作者单位:常新建,任有蛇,岳文斌,CHANG Xin-jian,REN You-she,YUE Wen-bin(山西农业大学动物科技学院,山西,太谷,030801)姚继广,杨子森,YAO Ji-guang,YANG Zi-sen(山西省生态畜牧产业管理站,山西,太原,030001)
王慧生,赵兴财,WANG Hui-sheng,ZHAO Xi-cai(山西省岢岚县畜牧兽医局,山西,岢岚,036300)
白海全,BAI Hai-quan(山西省岢岚县绒山羊种羊场,山西,岢岚,036300)
刊 名:草食家畜 英文刊名:GRASS-FEEDING LIVESTOCK 年,卷(期): “”(1) 分类号:S814.8 关键词:山羊 微卫星标记 遗传多样性 杂合度 Nei氏遗传距离篇3:微卫星标记分析乌江流域白甲鱼群体的遗传多样性
微卫星标记分析乌江流域白甲鱼群体的遗传多样性
以乌江流域白甲鱼(Onychostoma sima)为材料,构建了白甲鱼微卫星富集文库.对乌江彭水电站坝上、坝下种群进行PCR扩增,得到5个多态位点,其等位基因数目3~6;多态信息含量0.4465~0.7116;观测杂合度0.4444~0.9310;期望杂合度0.4902~0.7624;Hardy-Weinberg平衡偏离指数-0.4171~0.2380,各位点两两之间不存在显著的连锁不平衡现象.实验初步表明:乌江流域白甲鱼的.遗传多样性较为丰富,但彭水水电站的建立已经对其造成了一定程度的影响.
作 者:熊美华 史方 徐念 阙延福 杨钟 胡菊香 朱滨 XIONG Mei-hua SHI Fang XU Nian QUE Yan-fu YANG Zhong HU Ju-xiang ZHU Bin 作者单位:水利部中国科学院水工程生态研究所,湖北,武汉,430079 刊 名:水生态学杂志 英文刊名:JOURNAL OF HYDROECOLOGY 年,卷(期):2009 2(2) 分类号:Q346+.5 关键词:白甲鱼 微卫星 遗传多样性 乌江流域篇4:尼西鸡遗传多样性微卫星标记分析
尼西鸡遗传多样性微卫星标记分析
尼西鸡抗病力强,产蛋性能高,适应高海拔及寒冷的'气候条件,是具有独特群体遗传特性的高原地方鸡种.为了对其有效保护和合理利用提供遗传背景资料,筛选了家鸡基因组24条染色体上的33个微卫星标记,对随机选取的50个尼西鸡个体进行多态性检测,共检测到122个等位基因,每个座位平均等位基因数为3.7个.该群体平均多态信息含量和平均杂合度分别为0.551 4和0.635 0,大染色体较小染色体的微卫星多态性程度高.表明尼西鸡属多态性较丰富的群体.
作 者:叶朗惠 霍金龙 苗永旺 朱胜全 陈涛 刘丽仙 潘伟荣 毕保良 YE Lang-hui HUO Jin-long MIAO Yong-wang ZHU Sheng-quan CHEN Tao LIU Li-xian PAN Wei-rong BI Bao-liang 作者单位:叶朗惠,霍金龙,陈涛,潘伟荣,毕保良,YE Lang-hui,HUO Jin-long,CHEN Tao,PAN Wei-rong,BI Bao-liang(云南农业大学,动物科学技术学院,云南,昆明,650201)苗永旺,MIAO Yong-wang(云南农业大学,动物科学技术学院,云南,昆明,650201;云南大学,生物资源保护与利用国家重点实验室,云南,昆明,650091)
朱胜全,ZHU Sheng-quan(云南省种羊场,云南,寻甸,655205)
刘丽仙,LIU Li-xian(云南农业职业技术学院,畜牧兽医系,云南,昆明,650212)
刊 名:动物学研究 ISTIC PKU英文刊名:ZOOLOGICAL RESEARCH 年,卷(期): 27(1) 分类号:Q347 关键词:尼西鸡 微卫星标记 遗传多样性 多态信息含量 杂合度篇5:微卫星分析四个大黄鱼群体的遗传多样性
微卫星分析四个大黄鱼群体的遗传多样性
为保护人工养殖大黄鱼的种质资源,用15对微卫星标记对来自浙江沿海地区的四个大黄鱼养殖群体共171个个体进行了遗传多样性分析.结果显示,这些标记在四个群体中均表现出丰富的多态性;共检测到206个等位基因;各基因座观测等位基因数7~23个,平均等位基因数13.73,大小在88~318bp之间.四个群体的.平均观测杂和度(Ho)为0.5981~0.6893,期望杂和度(He)为0.7319~0.7944,多态信息含量(PIC)0.7138~0.7836,表明四个养殖群体在所检测位点均具有较好的多态性.对遗传距离的计算结果表明闵粤东群体与反交群体较近,聚类结果中首先聚到一起.本研究首次选择微卫星标记评估人共选育大黄鱼群体的遗传多样性,并采用高精度的377 DNA测序仪进行检测,将对大黄鱼的种质资源保护提供科学依据.
作 者:王文文 常玉梅 梁利群 WANG Wen-wen CHANG Yu-mei LIANG Li-qun 作者单位:王文文,WANG Wen-wen(南开大学生命科学学院,天津,300071)常玉梅,梁利群,CHANG Yu-mei,LIANG Li-qun(中国水产科学院黑龙江水产研究所,黑龙江,哈尔滨,150070)
刊 名:水产学杂志 英文刊名:CHINESE JOURNAL OF FISHERIES 年,卷(期): 22(2) 分类号:Q953 关键词:微卫星标记 大黄鱼 遗传多样性 荧光引物篇6:山东省三个鲤鱼群体遗传多样性及亲缘关系的微卫星标记分析
山东省三个鲤鱼群体遗传多样性及亲缘关系的微卫星标记分析
利用微卫星标记技术对3个鲤鱼群体(DP、WS和SY)的遗传多样性及亲缘关系进行研究.结果表明,3个群体的遗传多样性总体水平较高,其中SY群体最高,WS群体次之,DP群体最低.根据基因型频率(P)检验了各位点的HardyWeinberg平衡情况.Fis值表明3个群体中共有32个微卫星位点的杂合度观测值过剩.3个群体间,WS和SY群体间的`遗传相似系数最大(0.8320),遗传距离最小(0.1680),表明这两个群体亲缘关系较近;WS和DP群体间的遗传相似系数最小(0.8288),遗传距离最大(0.1712),表明这两个群体亲缘关系较远.
作 者:马洪雨 岳永生 郭金峰 公维华 王慧 MA Hongyu YUE Yongsheng GUO Jinfeng GONG Weihua WANG Hui 作者单位:马洪雨,岳永生,郭金峰,王慧,MA Hongyu,YUE Yongsheng,GUO Jinfeng,WANG Hui(山东农业大学动物分子遗传育种实验室,泰安,271018)公维华,GONG Weihua(中国农业科学院畜牧研究所,北京,100094)
刊 名:湖泊科学 ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF LAKE SCIENCES 年,卷(期): 18(6) 分类号:Q95 关键词:鲤鱼 微卫星 遗传多样性 亲缘关系篇7:利用微卫星标记分析泸水中华蜜蜂遗传多样性
利用微卫星标记分析泸水中华蜜蜂遗传多样性
利用21 对微卫星标记对云南泸水中华蜜蜂群体遗传多样性进行分析,共检测到121个等住基因,等位基因数目从2-12不等.平均等位基因数为5.76;所有位点的平均期望杂合度(He)和平均多态信息含量(PIC)值分别为0.6752和0.6192.表明泸水中华蜜蜂群体遗传多样性较为丰富.
作 者:林道密 殷玲 吉挺 刘敏 陈国宏 Lin Daomi Yin Ling Ji Ting Liu Min Chen Guohong 作者单位:林道密,Lin Daomi(福建长乐市首占镇人民政府,长乐,350202)殷玲,吉挺,刘敏,陈国宏,Yin Ling,Ji Ting,Liu Min,Chen Guohong(扬州大学动物科学与技术学院,扬州,225009)
刊 名:中国蜂业 英文刊名:APICULTURE OF CHINA 年,卷(期): 60(5) 分类号:S893.2 关键词:中华蜜蜂 微卫星 遗传多样性篇8:利用微卫星标记分析6个山羊品种遗传多样性
利用微卫星标记分析6个山羊品种遗传多样性
利用微卫星标记技术,分析了山西黎城大青羊、吕梁黑山羊、阳城白山羊、新疆南疆山羊、新疆北疆山羊以及宁夏中卫山羊6个地方山羊品种的分子水平上的.遗传多样性,结果表明:19个微卫星位点均为中度和高度多态位点,平均多态信息含量(PIC)达0.6859~0.7083;6个品种平均位点杂合度在0.3832~0.4277之间.遗传分化系数表明:BM203、BM023、BMS6526和BM875 4个位点的遗传分化系数(GST)估算值较大,分别为0.0475、0.0491、0.0107和0.0262,BM3033值最小,为0,表明前4个位点在不同品种间的基因分化占总群杂合度的4.75%、4.91%、1.07%和2.6%;其它位点遗传分化系数(GST)值不高,遗传变异主要存在于各个品种内,品种间遗传变异不大.以Nei氏标准遗传距离的UPGMA和N-J聚类结果表明,吕梁黑山羊与阳城白山羊具有较近的亲缘关系,黎城大青羊与新疆南疆山羊具有较近的亲缘关系;以共祖距离的UPGMA和N-J聚类结果,阳城白山羊与新疆南疆山羊亲缘关系较近,山西地方山羊与新疆山羊有可能存在一定的基因交流.
作 者:张爱玲 马月辉 李宏滨 关伟军 浦亚斌 张英汉 陈宏 赵倩君 何晓红 ZHANG Ai-Ling MA Yue-Hui LI Hong-Bin GUAN Wei-jun PU Ya-Bin ZHANG Ying-Han CHEN Hong ZHAO Qian-Jun HE Xiao-Hong 作者单位:张爱玲,ZHANG Ai-Ling(中国农业科学院畜牧研究所,北京,100094;西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100)马月辉,李宏滨,关伟军,浦亚斌,赵倩君,何晓红,MA Yue-Hui,LI Hong-Bin,GUAN Wei-jun,PU Ya-Bin,ZHAO Qian-Jun,HE Xiao-Hong(中国农业科学院畜牧研究所,北京,100094)
张英汉,陈宏,ZHANG Ying-Han,CHEN Hong(西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100)
刊 名:农业生物技术学报 ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY 年,卷(期): 14(1) 分类号:S181 S188 关键词:山羊 微卫星 遗传多样性 系统发生 遗传分化系数篇9:用6个微卫星座位研究BMY牛和婆罗门牛的遗传多样性和群体遗传结构
用6个微卫星座位研究BMY牛和婆罗门牛的遗传多样性和群体遗传结构
对6个牛微卫星座位的遗传变异及多态性分析,以期了解BMY牛和婆罗门牛的`群体遗传结构与育成情况.6个微卫星座位的多态信息含量为在0.524~0.752间,BMY牛、婆罗门牛两个群体的平均期望杂合度和观察杂合度值接近,分别为0.737 6和0.739 6,0 641 2和0.653 7,进入横交固定第二世代的BMY牛期望杂合度值较高,这与我们的育种进展相符.红安格斯的期望杂合度较低(0.460 9)接近日本和牛0.471,暗示红安格斯牛的同质性较高.
作 者:开兴 朱芳贤 吴桂生 聂龙 金显栋 杨国荣 袁希平文际坤 张亚平QU Kai-Xing ZHU Fang-Xian WU Gui-Sheng NIE Long JIN Xian-Dong YANG Guo-Rong YUAN Xi-Ping WEN Ji-Kun ZHANG Ya-Ping 作者单位:开兴,QU Kai-Xing(云南省肉牛和牧草研究中心,昆明,650212;中国科学院昆明动物研究所云南省畜禽分子生物学重点实验室、细胞与分子进化重点实验室,昆明,650223)朱芳贤,金显栋,杨国荣,袁希平,文际坤,ZHU Fang-Xian,JIN Xian-Dong,YANG Guo-Rong,YUAN Xi-Ping,WEN Ji-Kun(云南省肉牛和牧草研究中心,昆明,650212)
吴桂生,聂龙,张亚平,WU Gui-Sheng,NIE Long,ZHANG Ya-Ping(中国科学院昆明动物研究所云南省畜禽分子生物学重点实验室、细胞与分子进化重点实验室,昆明,650223)
刊 名:遗传 ISTIC PKU英文刊名:HEREDITAS(BEIJING) 年,卷(期):2006 28(3) 分类号:Q953 关键词:BMY牛 婆罗门牛 遗传多样性 微卫星篇10:六个中国固有绵羊品种遗传关系的微卫星标记分析
六个中国固有绵羊品种遗传关系的微卫星标记分析
用5对微卫星引物对哈萨克羊、蒙古羊、兰州大尾羊、同羊、大尾寒羊、小尾寒羊共6个中国固有绵羊品种基因组进行了扩增,对扩增结果用7种聚类方法(欧氏距离、欧氏平方距离、夹角余弦、皮尔逊相关、车贝雪夫距离、街区距离、明考夫斯基距离)进行了分析.结果表明,分布在我国西北部的绵羊品种哈萨克羊、蒙古羊、兰州大尾羊在大多数情况下总是先聚在一起,相对分布于中原地带的同羊、小尾寒羊和西北部的3个品种间距离较远;同羊和小尾寒羊之间距离也很远;大尾寒羊和小尾寒羊之间没有明显的遗传关系,此结果与<中国绵羊品种志>中记载的'情况基本一致.同时,本研究结果也说明7种聚类方法均适用于微卫星标记资料的遗传分析.
作 者:雷雪芹 徐廷生 陈玉林 陈宏 袁志发 LEI Xue-Qin XU Ting-Sheng CHEN Yu-Lin CHEN Hong YUAN Zhi-Fa 作者单位:雷雪芹,LEI Xue-Qin(河南科技大学动物科技学院,洛阳,471003;西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100)徐廷生,XU Ting-Sheng(河南科技大学动物科技学院,洛阳,471003)
陈玉林,袁志发,CHEN Yu-Lin,YUAN Zhi-Fa(西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100)
陈宏,CHEN Hong(西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100;徐州师范大学生物技术研究所,徐州,221009)
刊 名:中国生物化学与分子生物学报 ISTIC PKU英文刊名:CHINESE JOURNAL OF BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY 年,卷(期):2006 22(1) 分类号:Q343 关键词:绵羊 微卫星标记 聚类分析 遗传关系【乌骨鸡蛋用系群体遗传结构的微卫星标记分析】相关文章:
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