植物查尔酮异构酶的生物信息学分析

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篇1：植物查尔酮异构酶的生物信息学分析

植物查尔酮异构酶的生物信息学分析

采用生物信息学方法和工具对GenBank中的洋葱、豌豆、番茄和茶等植物的黄酮类化合物合成关键酶查尔酮异构酶(CHI)的`核酸和氨基酸序列进行了比对、分析和建模,进而对其分子结构、理化性质、亚细胞定位、蛋白转运肽、跨膜结构域、疏水性、分子系统进化、蛋白质二级和三级结构等重要参数进行了预测和推理.结果表明:该类酶基因的全长包括5'、3'非翻译区和一个开放阅读框,无蛋白转运肽,且定位于细胞质基质,是一个疏水性蛋白,二级结构均以随机卷曲和α-螺旋为主要构件,洋葱和豌豆的CHI三维建模成功.

作 者：雷桅 邹祥 向阳 汤绍虎 孙敏 LEI Wei ZOU Xiang XIANG Yang TANG Shao-hu SUN Min  作者单位：雷桅,向阳,汤绍虎,孙敏,LEI Wei,XIANG Yang,TANG Shao-hu,SUN Min(西南大学,生命科学学院,三峡库区生态环境教育部重点实验室,重庆,400715)

邹祥,ZOU Xiang(西南大学药学院,重庆,400715)

刊 名：北方园艺  PKU英文刊名：NORTHERN HORTICULTURE 年，卷(期)： “”(2) 分类号：Q946.5 Q558 关键词：查尔酮异构酶   生物信息学   黄酮类化合物  

篇2：植物乳杆菌共轭亚油酸异构酶基因的克隆、序列分析及重组表达

植物乳杆菌共轭亚油酸异构酶基因的克隆、序列分析及重组表达

利用MRS培养基培养植物乳杆菌AS1.555,收集菌体后提取总DNA,用PCR技术扩增其亚油酸异构酶基因,克隆到pQE30质粒载体上,并进行测序.测序结果表明,扩增DNA全长1710 bp,编码569个氨基酸,分子量为64.7 ku.经同源性比较,此核酸序列与罗伊氏乳杆菌、短双歧杆菌、疮疱丙酸杆菌亚油酸异构酶基因核苷酸序列差别较大,推测此基因的.来源与上述菌种不同.

作 者：相丽新 曹健 王红军 尹艳丽 王育军 于海东 张琳 董理 XIANG Li-xin CAO Jian WANG Hong-jun YIN Yan-li WANG Yu-jun YU Hai-dong ZHANG Lin DONG Li  作者单位：河南工业大学生物工程学院,河南,郑州,450001 刊 名：化学与生物工程  ISTIC英文刊名：CHEMISTRY & BIOENGINEERING 年，卷(期)：2007 24(6) 分类号：Q78 关键词：植物乳杆菌   亚油酸异构酶基因   克隆   序列分析  

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